Epigenetic regulation of renal fibrosis in diabetic nephropathy: focus on histone modifications


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/nephrology.2018.2.68-76

K.A. Aitbaev, I.T. Murkamilov, Zh.A. Murkamilova, V.V. Fomin

1 Research Institute of Molecular Biology and Medicine under the National Center for Cardiology and Therapy of the Ministry of Health of the Kyrgyz Republic; Bishkek, Kyrgyzstan; 2 I.K. Akhunbaev Kyrgyz State Medical Academy; Bishkek, Kyrgyzstan; 3 Acad. Mirsaid Mirrakhimov National Center for Cardiology and Therapy under the Ministry of Health of the Kyrgyz Republic; Bishkek, Kyrgyzstan; 4 Center for Family Medicine № 7; Bishkek, Kyrgyzstan; 5 FSBEI HE "Sechenov First Moscow State Medical University"; Moscow, Russia
One of the most common causes of the development of the end-stage renal disease is diabetic nephropathy (DNP). Renal fibrosis, characterized by the accumulation of extracellular matrix (ECM) proteins in the glomerular basement membrane and tubulointerstitial tissues, is the terminal manifestation of DPN. The signaling pathway of TGF-β (Transforming growth factor beta) triggers an epithelial-mesenchymal transition (EMT), which plays a key role in the accumulation of ECM proteins in DPN. The studies show that DNP continues to progress despite the glycemic control. This phenomenon is called "metabolic memory" and means that epigenetic factors, in particular histone modifications, alter the TGF-β1-induced of renal fibrosis gene and ECM protein expression, and also participate in renal fibrosis due to capability to regulate the EMT process caused by TGF-β signaling. In this regard, researchers are currently making efforts to develop agents affecting the histone modifications, in order to delay, stop, or even reverse the development of DPN. This review presents the results of the most recent studies on the regulation of histone modifications involved in the pathogenesis of DPN.

Введение

В последние годы заболеваемость хронической болезнью почек растет угрожающими темпами. Если эта тенденция сохранится, то не только у бедных, но даже и у богатых стран не хватит ресурсов для адекватного лечения этого заболевания [1]. Хотя почка обладает способностью к регенерации и восстановлению после острого и хронического повреждения, часто патологический процесс приобретает необратимый характер, что приводит к кратковременному почечному коллапсу, требующему диализа или почечной трансплантации [2]. В целом через 10–15 лет после постановки диагноза прогрессирующей нефропатии у 30–40% людей развивается значительная почечная недостаточность [3]. По оценкам, в настоящее время от 1 до 2 млн человек лечат заместительной почечной терапией (ЗПТ) [3–5], причем более 90% этих пациентов живут в развитых странах, т.к. доступность ЗПТ в развивающихся странах ограничена, а в слаборазвитых странах невелика или отсутствует вследствие того, что ЗПТ представляет собой дорогостоящую нагрузку на национальные бюджеты здравоохранения [3].

Одной из основных причин развития почечной недостаточности является диабетическая нефропатия (ДН), которая развивается примерно у 20–40% пациентов с диабетом [6]. Точная причина ДН неизвестна, однако установлено, что ее развитию способствуют высокий уровень глюкозы в крови, дислипидемия, артериальная гипертензия и протеинурия [7]. Все это стимулирует продукцию различных факторов роста/цитокинов и активных форм кислорода (АФК), которые вызывают повреждение подоцитов и воспаление интерстиция. В результате этих событий происходит избыточное осаждение белков внеклеточного матрикса (ВКМ) и развитие гломерулосклероза, что в конечном итоге приводит к дисфункции клубочков и почечной недостаточности [7, 8].

Фиброз почек при ДН характеризуется непрерывным осаждением ВКМ-белков – коллагена, фибронектина и ламинина в мезангиальном матриксе, клубочковых базальных мембранах и тубулоинтерстиции [9]. Известно, что даже после контроля гипергликемии у пациентов с диабетом может продолжаться развитие клубочкового и тубулоинтерстициального фиброза [10]. Эти данные свидетельствуют о том, что эпигенетика может играть существенную роль в патобиологии ДН [11].

Роль фиброза почек при ДН

Избыточное накопление ВКМ-белков является отличительной чертой ДН [9, 12]. Это подтверждается наблюдениями, демонстрирующими осаждение в повышенных количествах коллагенов, фибронектина и ламинина в клубочковой базальной мембране и мезангиальном ВКМ уже на ранних стадиях ДН (микроальбуминурия), что приводит к развитию диабетического диффузного гломерулосклероза [9, 13–15]. На стадиях выраженной нефропатии осаждение коллагенов I и III типов сильно возрастает [16, 17]. Кроме того, продемонстрировано повышение содержания коллагена IV типа в сыворотке и моче на ранних и поздних стадиях ДН [18–20]. Таким образом, накопление белков ВКМ при ДН происходит на протяжении всего процесса почечного фиброза.

TGF-β1 (Transforming growth factor beta), цитокин широкого спектра действия [21, 22], индуцируемый гипергликемией, конечными продуктами усиленного гликозилирования, митоген-активируемой протеинкиназой и протеинкиназой C [23], играет решающую роль в прогрессировании гипертрофии клубочков и избыточном осаждении матричных белков при ДН [24, 25]. Индуцируемое гиперликемией увеличение осаждения матричных белков, приводящее к гломерулосклерозу, связано с повышенной экспрессией и активацией TGF-β1 в клубочковых клетках, подоцитах [26] и мезангиальных клетках [27]. Кроме того, TGF-β1 может также стимулировать действие альфа-актин гладких мышц (α-SMA – α-smooth muscle actin), экспрессию коллагена I типа и гипертрофию клеток [28, 29]. Другой цитокин, фактор роста соединительной ткани CTGF (connective tissue growth factor), также является весьма важным профибротическим фактором роста, участвующим как в TGF-β-зависимых, так и в TGF-β-независимых фибротических процессах [30–32]. Было показано, что профибротическое действие TGF-β1 может быть блокировано антисмысловыми олигонуклеотидами CTGF [33]. Также установлено, что активация CTGF может увеличивать экспрессию фибронектина и коллагенов IV, III и I, а также способствовать осаждению и скоплению белков ВКМ [34, 35].

По сообщениям, активированные миофибробласты – это основные эффекторные клетки при ДН, а их число коррелирует с избыточным осаждением белков ВКМ [36]. Однако точные механизмы их возникновения и активации в фиброзных почках остаются неясными. Исследования P. Galichon и А. Hertig [37] показали, что в процессе почечного фиброза миофибробласты могут возникать из трубчатых эпителиальных клеток через эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП). Обычно принято считать, что трансформация нарушенных трубчатых эпителиальных клеток в мезенхимальные является наиболее вероятным механизмом, связанным с развитием фиброза при ДН [36]. Как in vitro-, так и in vivo-исследования показали, что ЭМП может быть инициирован рядом агентов, стимулирующих процессы, в которых основным участником является профибротический элемент – TGF-β1 [38, 39].

ДН и метаболическая память

Известно, что у пациентов с диабетом, которые ранее имели высокие уровни глюкозы, несмотря на достижение в последующем гликемического контроля, продолжают развиваться диабетические осложнения, в т.ч. и ДН. Это явление получило название «метаболическая память». Так, в исследовании DCCT (Diabetes Control and Complications Trial) сравнивали два режима инсулиновой терапии пациентов с диабетом 1 типа – обычный и интенсивный. Оказалось, что интенсивный режим инсулинотерапии в большей степени снижает частоту или тяжесть ДН, периферической невро- и ретинопатии по сравнению с обычным режимом [40]. Впоследствии наблюдение за когортой пациентов DCCT было продолжено, но уже в другом исследовании, названном EDIC (Epidemiology of Diabetes Interventions and Complications). Участники EDIC обследовались ежегодно в течение 8 лет. Было установлено, что пациенты, которые поддерживали строгий контроль гликемии в исследовании DCCT, имели лучший прогноз в отношении отсрочки развития ДН. Кроме того, прогрессирование ДН у них было гораздо менее агрессивным, чем у пациентов обычной группы, хотя уровни гликозилированного гемоглобина существенно не различались в этих группах во время фазы EDIC [41]. Эти результаты нашли подтверждение в работе G. Schernthaner [42], где пациенты с сахарным диабетом (СД) 2 типа, находившиеся под интенсивным контролем гликемии, демонстрировали долгосрочные полезные эффекты в виде уменьшения как макро-, так и микрососудистых осложнений, что было объяснено влиянием «наследственных факторов» [42].

Концепция «метаболическая память» получила дополнительную поддержку в исследованиях, выполненных на экспериментальных моделях животных. Например, S. Li et al. [43] показали, что сосудистые гладкомышечные клетки, взятые из аорты мышей линии db/db (СД 2 типа), демонстрировали повышенные провоспалительные реакции по сравнению с контрольными недиабетическими мышами (db/+). Аналогичным образом крысы с СД 1 типа, которые имели гипергликемию в течение нескольких недель до индуцирования нормогликемии, показали прогрессирование ДН [44]. Схожие данные получены на диабетических крысах: несмотря на трансплантацию клеток островков Лангерганса, которая восстановила нормогликемию у экспериментальных животных после 6 недель диабета, прогрессирование диабетической ретинопатии у них продолжилось [45]. Приведенные наблюдения свидетельствуют о ключевой роли метаболической памяти в развитии диабетических осложнений, что требует проведения более глубоких и интенсивных исследований для определения молекулярных механизмов, лежащих в основе данного процесса. Кроме того, эти свидетельства дают основание предполагать, что эпигенетические факторы могут влиять на патобиологию метаболической памяти и диабетических осложнений.

Эпигенетика и модификации гистонов

Термин «эпигенетика», первоначально предложенный К. Уоддингтоном [46], означал «изучение причинных механизмов реализации генома (генов) в фенотип». Впоследствии разными исследователями было предложено много других определений, суть которых сводится к тому, что эпигеном, который представляет собой совокупность эпигенетических маркеров, действует как мост между генетикой и окружающей средой, а эпигенетический код модифицирует экспрессию генов для определения конечного фенотипа без изменений в последовательностях ДНК [47]. Эпигенетические модификации могут изменять фенотип болезни, непосредственно влияя на ген-мишень как ответ на сигналы окружающей среды и патологические состояния, такие как диета, физические упражнения, токсины, окислительный стресс, воспаление и метаболические изменения [48]. Эпигенетические изменения гена (генов) оказывают большое влияние на формирование и развитие эмбриона, инактивацию Х-хромосом, геномный импринтинг, дифференциацию и идентичность клеток, стабильное наследование экспрессии генов, функцию иммунных клеток, пластичность стволовых клеток и клеточные ответы на сигналы окружающей среды [49, 50]. Модификации гистонов и метилирование ДНК наряду с некодирующими РНК, в совокупности известные как эпигенетические модификации, содержат эпигенетическую информацию, необходимую для стабильного наследования прототипов экспрессии генов в дифференцированных клетках [50]. Недавние исследования показали, что эпигенетические механизмы играют значительную роль в патобиологии СД и ДН.

Посттрансляционные модификации гистонов являются важной частью эпигенома, который поддерживает нормальные клеточные транскрипционные структуры [51]. Модификации гистонов, такие как ацетилирование лизина (Kac), метилирование лизина (Kme) и убиквитинирование лизина, а также фосфорилирование треонина и серина и метилирование аргинина, происходят в основном в аминоконцевых хвостах гистонов, легко доступных для ковалентных посттрансляционных модификаций [52]. В результате изменяется структура хроматина, что в свою очередь приводит к активации или подавлению таргентных генов вследствие модулирования связывания транскрипционных агентов с их соответствующими промоторными элементами ядра [53]. Недавно сообщалось, что модификации гистонов, особенно такие, как ацетилирование и метилирование гистонов, могут играть важную роль в патобиологии ДН.

Ацетилирование гистонов. Ацетилирование N-концевых хвостов гистонов H3K и H4K cчитается обратимым динамическим процессом [54]. Как правило, ацетилирование гистонов по лизину (например, H3K14ac, H3K9ac и H4K5ac) в области промоторов генов ведет к стимулированию транскрипции генов, тогда как удаление ацетилирования – к ингибированию [55]. Уровни ацетилирования гистонов определяются как гистонацетилтрансферазами HATs (histone acetyltransferases), так и гистондезацетилазами HDACs (histone deacetylases). Так, гистоновая ацетилтрансфераза p300/CBP, катализирующая реакцию ацетилирования лизина, является маркером хроматина, который приводит к активации гена. В то же время HDACs модулируют удаление ацетилирования и действуют как репрессоры транскрипции гена [50]. Кроме того, HDACs можно разделить на четыре класса в зависимости от сходства их последовательностей и кофакторных взаимодействий: класс I (HDACs 1, 2, 3 и 8) – ядерные ферменты, широко экспрессированные в разных типах тканей; класс II (HDACs 4, 5, 6,7, 9 и 10) и класс IV (HDAC 11), расположенные главным образом в цитоплазме, экспрессируются в определенных тканях; класс III охватывает семейство сиртуинов (SIRT1-7) [56, 57]. Экспрессия различных членов семейства HDACs варьируется от ткани к ткани и проявляет различные биологические свойства. Во взрослых почках экспрессированы все члены классов I и II HDAC [57].

Метилирование гистонов. В отличие от ацетилирования метилирование гистонов более стабильно и продолжительно [53], а также происходит как на аргининовых, так и на лизиновых остатках, которые могут быть моно-, ди- или триметилированными. Гистоновое метилирование в зависимости от модифицированного остатка может проявляться в виде репрессии или активации гена [58]. Как правило, H3K36me2/3, H3K4me1/2/3 и H3K79me2 имеют отношение к активации транскрипции гена, в то время как H3K9me2/3, H3K27me3 и H4K20me3 рассматриваются как репрессивные маркеры хроматина [59]. Несмотря на относительную стабильность, метилирование гистонов можно динамически модифицировать посредством согласованного действия гистонметилтрансфераз HМТs (histone methyltransferases) и гистондеметилаз HDMs (histone demethylases) [60]. В результате варьирования особенностей многочисленных HDMs в настоящее время изучается их потенциальная роль в развитии различных заболеваний.

Модификации гистонов участвуют в прогрессировании ДН

Существующие данные показывают, что эпигенетическая модификация гистонов играет важную роль в модулировании экспрессии генов почки при диабетических состояниях. В in vitro-, а также in vivo-исследованиях, связанных с диабетом, продемонстрировано изменение конфигурации метилирования и ацетилирования гистонов по лизину наряду с рекрутированием HATs/HDAC или HMTs на промоторы генов [11, 53, 61, 62]. Так, гиперацетилирование гистонов и повышенный уровень H3K4me были ассоциированы с модификацией экспрессии гена инсулина в ответ на изменение уровня глюкозы, которые коррелировали с [63, 64]. Сообщалось, что нокдаун гена гистоновой деметилазы Jhdm2a, которая деметилирует H3K9me2, приводит к ожирению и гиперлипидемии, что указывает на важную роль модификаций гистонов при СД [65]. Было обнаружено, что моноциты пациентов с СД 1 и СД 2 типов имеют повышенные уровни H3K9/14Ac наряду с рекрутированием HAT p300/CBP на промоторы воспалительных генов TNF-α (tumor necrosis factor-α) и COX-2 (cyclooxygenase-2), что способствовало усилению экспрессии этих воспалительных генов [66]. Сообщалось также, что в ответ на TGF-β1 почечные мезангиальные клетки индуцировали транскрипцию фиброзных генов, а на высокую концентрацию глюкозы повышали уровень активных хроматиновых меток (H3K4me1/2/3, H3K9/14Ac) и снижали уровень репрессивных маркеров (H3K9me2/me3) в промоторах этих генов наряду с оккупированием промоторов фиброзных генов гистон-лизин-ацетилтрансферазой (p300/CBP) и гистон-лизин-метилтрансферазой (SET7) [67, 68]. С другой стороны, эти эффекты существенно отменялись с помощью HAT-доменных мутаций глушения гена p300/CBP или SET7/9.

Исследования на животных моделях также продемонстрировали наличие эпигенетических модификаций гистонов при ДН. Так, были описаны глобальные изменения гистонов, ассоциированные с транскрипцией фиброзных генов, имеющих отношение к ДН [49]. У мышей с СД 1 типа индуцированный СД рост ацетилирования гистонов и активности HAT, а также обогащение промоторов фиброзных генов гистонами H3K9/14Ac и HAT p300/CBP способствовали активации экспрессии фиброзных генов, которые были в значительной степени угнетены в результате терапии с использованием C66 – нового куркуминового аналога [69]. В этих исследованиях подчеркивается решающая роль, которую играют эпигенетические модификации гистонов в патогенезе диабетической болезни почек. Лучшее понимание этих вариаций ацетилирования и метилирования остатков лизина гистонов может помочь в идентификации новых биомаркеров и терапевтических мишеней для ДН.

Модификации гистонов участвуют в почечном фиброзе

Ключевым элементом ДН служит избыточное накопление в почках ВКМ-белков – фибронектина, коллагенов и ламинина [70]. В связи с этим получены веские доказательства того, что почечный фиброз стимулируется TGF-β1, который в свою очередь играет важную роль в инициировании ЭMП и накоплении белков ВКМ [23, 71, 72]. Исследования также показали, что в этих процессах принимают участие и гистоновые модификации, оказывая влияние на экспрессию и регуляцию сигнальных путей, которые опосредуют почечный фиброз при ДН.

Модификации гистонов способствуют экспрессии профибротических факторов

Профибротические цитокины, в частности ингибитор активатора плазминогена 1 – PAI-1 (plasminogen activator ingbitor-1), фактор роста соединительной ткани CTGF (connective tissue growth factor) и p21, играют существенную роль в прогрессировании избыточного осаждения ВКМ-белков при ДН. Многие исследования показали, что экспрессия профибротических цитокинов регулируется изменениями гистонов при диабетических состояниях. Так, в культивированных мезангиальных клетках крысы высокая концентрация глюкозы и TGF-β1 индуцировали повышение активных меток Kme (H3K4me1, 2 и 3) и снижение ингибирующих меток (H3K9me2 и 3) на промоторах генов PAI-1 и CTGF, которые сопровождались накоплением HMT SET7/9 на фибробластах и промоторах генов ВКМ-белков, вызывая повышенную экспрессию этих профибротических белков ВКМ [68]. Аналогично в обработанных TGF-β1 и глюкозой в высокой концентрации крысиных мезангиальных клетках обогащение промоторов генов PAI-1 и p21 гистонами H3K9/14Ac и HAT p300/CBP способствовало ускорению выработки PAI-1 и p21 [67]. В исследовании с использованием мышей с СД 1 типа экспрессия генов CTGF и PAI-1 почек была усилена посредством стимулирования ацетилирования гистонов и активности HAT, а также обогащением промоторов генов CTGF и PAI-1 ацетильными модификациями H3K9/14Ac и гистонацетилтрансферазой p300/CBP [69].

Модификации гистонов активируют продукцию белков ВКМ

ВКМ-белки, а именно коллаген, ламинин и фибронектин, аккумулированные в мезангиальной матрице, клубочковых базальных мембранах и тубулоинтерстиции, служат патологическим признаком ДН. В связи с этим показано, что эпигенетические модификации гистонов могут влиять на прогрессирование почечного фиброза при ДН посредством регуляции транскрипции белков ВКМ.

По сообщениям, экспрессия коллагеновых генов при ДН может регулироваться с помощью модификаций гистонов через: 1) рекрутирование HATs/HDACs и HMTs на промоторы коллагеновых генов и 2) изменения уровней метилирования и ацетилирования лизиновых остатков гистонов. В нескольких исследованиях показано, что гистон-ацетилтрансфераза-р300 ускоряет экспрессию коллагена COL1A1/COL1A2 при многочисленных физиологических и патологических клеточных процессах [62, 73–75]. Культивированные трубчатые эпителиальные клетки почек у диабетических мышей демонстрировали повышенную экспрессию миокардин-сязанного фактора транскрипции A (MRTF-A – myocardin-related transcription factor A), что способствовало рекрутированию p300 и протеина WDR5 (WD repeat domain 5) на промоторы коллагеновых генов, вызывая активацию их транскрипции [76]. Напротив, выключение MRTF-A привело к исчезновению ацетилированных (H3K18/K27) и триметилированных (H3K4) гистонов, свидетельствуя об угнетении их транскрипции. G. Sun et al. [68] обнаружили, что обработка мезангиальных клеток крысы TGF-β1 и глюкозой высокой концентрации повышала на промоторах гена коллагена-α1 уровни положительных меток хроматина, таких как H3K4me1, H3K4me2 и H3K4me3, и снижала уровни ингибирующих меток, включая H3K9me2 и H3K9me3. Установлено, что эти изменения были связаны с рекрутированием метилтрансферазы SET7/9 на промоторы гена коллагена-α1, что в конечном итоге привело к усилению экспрессии гена коллагена-α1. С помощью исследований siRNA показано, что замалчивание гена SET7/9 угнетает экспрессию гена коллагена-α1, индуцированную TGF-β1. В крысиных мезангиальных клетках, культивируемых в диабетических условиях или предварительно обработанных TGF-β1, экспрессия метилтрансферазы SET7 возрастала наряду с повышением уровня SET7 на промоторах фиброзного гена Col1a1/Col4a1. Напротив, подавление гена SET7 угнетало экспрессию гена Col1a1/Col4a1 [77].

Кроме того, в обработанных глюкозой мезангиальных клетках и у диабетических животных модификации гистонов стимулировали транскрипцию гена фибронектина и накопление ВКМ-белков, что в конечном итоге способствовало развитию почечного фиброза. Это подтвердилось данными экспериментальных исследований. Так, в крысиных мезангиальных клетках, предварительно обработанных TGF-β1 и глюкозой в высокой концентрации, H3K9/14Ac и HAT p300/ CBP скапливались на промоторах гена фибронектина-1 (FN-1), что вызывало стимуляцию экспрессии FN-1 [67]. В другом исследовании отмечено, что экспрессия гена почечного FN-1 у мышей с СД 1 типа была усилена путем обогащения промоторов гена FN-1 H3K9/14Ac и HAT p300/CBP, что вызывало развитие почечного фиброза и проявлений ДН [69].

Исследования на культуре клеток и животных подтвердили влияние HDAC на регуляцию накопления ВКМ-белков и почечного фиброза при DKD [73]. Более того, недавнее исследование показало экспрессию различных HDACs в почках пациентов с СД и стрептозотоцин (STZ)-индуцированным диабетом крыс, которые доказывают, что HDAC4 играет значительную роль в прогрессировании ДН [79].

Модификации гистонов стимулируют процесс ЭМП

Роль ЭМП в качестве важного механизма, способствующего трансформации поврежденных почечных трубчатых клеток в мезенхимальные клетки, широко дискутируется исследователями. Этот переход от почечных трубчатых клеток к мезенхимальным при хронической почечной недостаточности, а также ДН, как правило, приводит к дисфункции всех отделов нефрона [23, 36]. Показано, что одним из механизмов участия гистоновой модификации в фиброзе почек является активация прогрессирования ЭМП. Так, M. Yoshikawa et al. [80] сообщили о глобальном снижении уровня маркера гетерохроматина H3K9Me2, повышении уровня маркера эухроматина H3K4Me3 и об увеличении транскрипционного маркера H3K36Me3 в процессе развития ЭМП. Исследования на модели односторонней обструкции уретры показали, что TGF-β1-индуцированный ЭMП в трубчатых эпителиальных клетках крысы может быть блокирован трихостатином A (TSA), неселективным ингибитором HDAC, что приводит к подавлению экспрессии гена фибронектина и α-SMA в почках [81]. Кроме того, TSA ингибировал TGF-β1-стимулированный ЭMП в эпителиальных клетках проксимальных извитых почечных канальцев человека [80]. Аналогичные результаты были также зарегистрированы при STZ-индуцированном диабете и обработанных TGF-β1 трубчатых эпителиальных клетках нормальной почки крысы (NRK52-E), что указывает на то, что HDAC-2 играет важную роль в прогрессировании ДН [82].

Сигнальный путь TGF-β регулирует модификацию гистонов

Сигнальный путь TGF-β имеет особое значение в стимуляции экспрессии генов фиброза и ВКМ-белков в условиях диабета или гипергликемии. Полагают, что TGF-β1 регулирует экспрессию фибротических генов путем активации факторов транскрипции, включая Smad2, Smad3 и Smad4, во взаимодействии с HAT и факторами ремоделирования хроматина. Эта точка зрения подтверждается данными, согласно которым обработка мезангиальных клеток крыс TGF-β1 и глюкозой в высокой концентрации приводит к возрастанию взаимодействия H3K9/14Ac и HAT p300/CBP с сайтами связывания Sp1 и Smad на промоторах генов PAI-1 и p21 наряду с усилением взаимодействия между p300 и Smad2/3 и Sp1, а также увеличением ацетилирования Smad2/3 с последующим усилением продуцирования PAI-1 и p21 [67]. На модели культуры мезангиальных клеток крысы повышенная экспрессия генов Col1a1, PAI-1 и CTGF, индуцированная TGF-β1, была связана с ростом уровней активных меток Kme (H3K4me1, 2 и 3) и снижением уровней ингибирующих меток (H3K9me2 и 3) на их промоторах и сопровождалась накоплением HMT SET7/9 на промоторах фиброзных и ВКМ-генов [68]. Напротив, повышенные уровни фиброза почек и экстрацеллюлярных белков, вызванные гипергликемией, и изменения в промоторах H3Kac и H3Kme, а также в рекрутировании SET7 в значительной степени блокировались с помощью обработки клеток TGF-β1-антителами, что подчеркивает важную роль TGF-β1 в эпигенетических модификациях гистонов, индуцированных гипергликемией [67, 68]. Сообщалось и о значительном увеличении активности HDAC-2 в почках STZ-индуцированных диабетических крыс и db/db мышей, а также в обработанных TGF-β1 клетках NRK52-E [77]. Кроме того, MS-275, селективный ингибитор HDAC класса I, в значительной степени способствовал обратному развитию фиброза при ДН путем ингибирования TGF-β-сигнального пути и активации почечных фибробластов [83]. Таким образом, TGF-β1-индуцированное прогрессирование ЭМП и модификация гистонов, по-видимому, играют важную роль в накоплении белков ВКМ и развитии трубчатого интерстициального фиброза [80–82, 84]. Полученные данные указывают на то, что модификации гистонов при ДН модулируют экспрессию генов почечного фиброза и ВКМ-белков через TGF-β-сигнальный путь.

Эпигенетическая терапия фиброза почек

На основе доказательств, рассмотренных выше, предпринимаются попытки ингибировать активность HAT, HDAC и HMT, чтобы замедлить или остановить развитие ДН. Так, куркумин, ингибитор HAT-p300, предотвращал индуцированные глюкозой изменения в уровнях транскрипции гена, ассоциированного со снижением уровней ацетилирования гистонов [85, 86]. Однако дальнейшие исследования показали, что куркумин не снижал уровня альбуминурии, связанной с СД [87]. В то же время аналог куркумина, C66, напротив, в значительной степени предотвращал экспрессию гена фиброза почек у диабетических мышей, ингибируя связанное с диабетом увеличение экспрессии p300/CBP, активности HAT и ацетилирования гистонов [69]. Кроме того, появились данные, согласно которым ингибиторы HDAC с защитным эффектом на почки (вальпроевая кислота, TSA, SK-7041) могут служить потенциальными антифибротическими молекулами при ДН. Так, вальпроевая кислота (VPA – valproic acid), противоэпилептический и антимигренный препарат, является неспецифическим ингибитором HDAC. Недавнее исследование показало, что лечение VPA значительно подавляет гистологические изменения и фиброз в почках диабетических крыс, снижает экспрессию фиброзных генов и накопление ВКM-белков [88]. В почках крыс с STZ-индуцированным диабетом TSA подавлял экспрессию мРНК и белков ВКМ, замедлял прогрессирование ЭМП [82]. Подобные полезные эффекты наблюдались также в исследованиях in vitro на клетках NRK52-E с VPA и SK-7041 (селективный ингибитор HDAC I класса). Из-за сложности процесса метилирования гистонов и многообразия HМТs эффекты ингибиторов HMT в почечном фиброзе при ДН остаются не вполне ясными. Однако недавнее исследование показало, что ингибирование гистондеметилазы JMJDA2A с помощью химического ингибитора 2,4-PDCA и siRNA подавляло миграцию, пролиферацию и воспаление гладкомышечных клеток сосудов, вызванное гипергликемией in vitro, и уменьшало образование неоинтимы при баллонном повреждении каротидных артерий у диабетических крыс [89].

Заключение

Патогенез ДН чрезвычайно сложен вследствие участия в нем множества взаимовлияющих патогенных факторов и сигнальных путей передачи информации. При этом, как уже указывалось выше, к отличительным признакам ДН относятся хронический непрекращающийся фиброз и осаждение в повышенных количествах ВКМ-белков в структурных компонентах почки.

В развитии почечного фиброза существенная роль принадлежит сигнальному пути TGF-β, который запускает процесс ЭМП, являющийся наиболее вероятным механизмом, связанным с развитием фиброза при ДН. Кроме того, установлено, что в прогрессировании диабетических осложнений, в т.ч. и ДН, ключевую роль играет т.н. метаболическая память, в основе которой могут лежать эпигенетические модификации гистонов. Это подтверждается результатами исследований, которые свидетельствуют о том, что в условиях диабета и гипергликемии эпигенетические модификации гистонов способствуют ренальному фиброзу и накоплению матричных белков через модулирование экспрессии соответствующих генов почки. Модификации гистонов, как выяснилось, участвуют в фиброзе почек также через регулирование прогрессирования ЭМП. Поскольку прогрессирование фиброза почек связано с модификациями гистонов, в настоящее время усилия исследователей направлены на поиск средств, влияющих на эти модификации, с целью остановить или ослабить процесс почечного фиброза.


About the Autors


Aitbaev K.A. – Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Laboratory of Pathological Physiology of the Research Institute of Molecular Biology and Medicine under the NCCT of the Ministry of Health of the Kyrgyz Republic; Bishkek, Kyrgyzstan
Murkamilov I.T. – PhD in Medical Sciences, Nephrologist of the 1-st qualification category, Teaching Assistant at the Department of Faculty Therapy, I.K. Akhunbaev KSMA; Bishkek; Kyrgyzstan. E-mail: murkamilov.i@mail.ru
Fomin V.V. – Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Department of Faculty Therapy № 1, FSAEI HE Sechenov First Moscow State Medical University of RMH; Moscow.
Murkamilova Zh.A. – Nephrologist at the Center for Family Medicine № 7; Bishkek, Kyrgyzstan


Similar Articles


Бионика Медиа